การดำเนินงานของศูนย์ อพ.สธ. มทส ในฐานะศูนย์แม่ข่าย ทำหน้าที่ประสานงาน สวนพฤกษศาสตร์ โรงเรียน และงานด้านทรัพยากรท้องถิ่น ประกอบด้วย
-สำนักงานบริการ อพ.สธ. มทส.
-สำนักอนุรักษ์พันธุกรรมพืชฯ อพ.สธ. คลองไผ่
-สำนักฝึกอบรมโครงการอนุรักษ์ฯ อพ.สธ. คลองไผ่
โดย นตภ. ดำเนินการตรวจสอบผลการดำเนินงานศูนย์ อพ.สธ.มทส. ประจำปี2565 ช่วงระหว่างวันที่ 27 มิถุนายน – 6 กรกฏาคม 2565 และได้รายงานผลการตรวจสอบให้หน่วยรับตรวจได้รับทราบผลการตรวจสอบและให้คำแนะนำที่เป็นประโยชน์ เพื่อให้สามารถนำไปประยุกต์ใช้ได้อย่างเหมาะสม